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八大胜官方网站:最终完成了中国莜麦的染色体组装

时间:2022/7/20 10:19:02   作者:   来源:   阅读:6   评论:0
内容摘要:现有的栽培燕麦在漫长的进化过程中经历了自然杂交和加倍,从二倍体到四倍体,最后到六倍体,包含A、C和D三个基因组,约110亿个碱基组成。碱基对组成,分布在细胞核3个亚基因组的21对染色体中。它的基因组庞大而复杂,大约是水稻基因组大小的40倍,其基因组DNA约有87%是重复的,因此很难对其基因组进行测序和组装。六倍体燕麦参...

现有的栽培燕麦在漫长的进化过程中经历了自然杂交和加倍,从二倍体到四倍体,最后到六倍体,包含A、C和D三个基因组,约110亿个碱基组成。碱基对组成,分布在细胞核3个亚基因组的21对染色体中。它的基因组庞大而复杂,大约是水稻基因组大小的 40 倍,其基因组 DNA 约有 87% 是重复的,因此很难对其基因组进行测序和组装。六倍体燕麦参考基因组是迄今为止科学家测序的所有物种中最复杂的基因组之一。

中国研究人员设计了一种超长测序技术,可以对较长的DNA片段进行高精度测序,并利用近20年的燕麦物种研究经验,筛选出最可能的栽培燕麦的四倍体和二倍体祖先,并结合采用HiC、二代测序、全长转录组测序、转录组测序等不同技术手段,最终完成了中国莜麦的染色体组装、镶嵌和注释,获得了优质莜麦参考基因组。在获得的燕麦参考基因组的基础上,中国研究人员也有了一些有趣的发现。在进一步选择能够代表燕麦属所有现有基因组类型的物种中,八大胜官方网站,结合水稻和小麦等其他密切相关的属,分析了燕麦在主要谷类作物中的进化地位以及栽培燕麦的起源和多倍体历史。从全基因组水平。后来,研究发现燕麦品种大约在800万年前生产。大约50万年前,人类旧石器时代,现在被广泛种植和食用的六倍体栽培燕麦是由AA基因组二倍体和CCDD基因组四倍体加倍形成的。

“作为六倍体作物,燕麦在生物量、活力和对环境变化的适应性方面具有显着优势,在应对粮食安全挑战方面可以发挥独特作用。”彭元英表示,对燕麦进化史的深入了解,将极大促进燕麦的渗透育种和性状从现存最接近的燕麦野生近缘种向栽培燕麦的转移,大力推动燕麦优良品种的选育。 .

此外,本研究基于参考基因组序列和注释信息,预测了与燕麦壳裸仁、抗病性等重要性状相关的关键基因位点,体现了参考基因组在重要性状和抗病性基因挖掘中的重要价值。燕麦分子育种。燕麦参考基因组的构建,作为燕麦研究时代的第一步,将使燕麦全基因组选择性育种和精准育种成为可能。


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